Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp1b4Q99ME6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp1b4Q99ME6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms