Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprtQ99M80 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC23.77■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprtQ99M80 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
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