Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rcbtb2Q99LJ7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms