Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp16Q99LG0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms