Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpifQ99KR7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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