Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Lactb2Q99KR3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lactb2Q99KR3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lactb2Q99KR3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lactb2Q99KR3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lactb2Q99KR3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lactb2Q99KR3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lactb2Q99KR3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lactb2Q99KR3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lactb2Q99KR3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lactb2Q99KR3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lactb2Q99KR3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lactb2Q99KR3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lactb2Q99KR3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lactb2Q99KR3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lactb2Q99KR3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lactb2Q99KR3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms