Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms