Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab28Q99KL7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab28Q99KL7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms