Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp11Q99K46 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms