Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Psmd6Q99JI4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Psmd6Q99JI4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms