Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnip2Q99JG7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms