Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Foxp3Q99JB6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Foxp3Q99JB6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms