Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apobec3Q99J72 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms