Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim7Q923T7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms