Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Odf3Q920N1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms