Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin3bQ91ZU9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Grin3bQ91ZU9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms