Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Creb3l3Q91XE9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Creb3l3Q91XE9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms