Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms