Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fyco1Q8VDC1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fyco1Q8VDC1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fyco1Q8VDC1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fyco1Q8VDC1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fyco1Q8VDC1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fyco1Q8VDC1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fyco1Q8VDC1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Fyco1Q8VDC1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fyco1Q8VDC1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fyco1Q8VDC1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fyco1Q8VDC1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fyco1Q8VDC1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fyco1Q8VDC1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fyco1Q8VDC1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms