Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms