Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rapgef3Q8VCC8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef3Q8VCC8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms