Protein–RNA interactions for Protein: Q8R349

Cdc16, Cell division cycle protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc16Q8R349 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cdc16Q8R349 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cdc16Q8R349 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cdc16Q8R349 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Cdc16Q8R349 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdc16Q8R349 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Cdc16Q8R349 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Cdc16Q8R349 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Cdc16Q8R349 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Cdc16Q8R349 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Cdc16Q8R349 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Cdc16Q8R349 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Cdc16Q8R349 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Cdc16Q8R349 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdc16Q8R349 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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