Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpv3Q8K424 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trpv3Q8K424 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms