Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PolbQ8K409 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms