Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Csnka2ipQ8CH19 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Csnka2ipQ8CH19 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Csnka2ipQ8CH19 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Csnka2ipQ8CH19 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Csnka2ipQ8CH19 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Csnka2ipQ8CH19 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Csnka2ipQ8CH19 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Csnka2ipQ8CH19 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Csnka2ipQ8CH19 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Csnka2ipQ8CH19 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Csnka2ipQ8CH19 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnka2ipQ8CH19 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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