Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Hpf1Q8CFE2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Hpf1Q8CFE2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Hpf1Q8CFE2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Hpf1Q8CFE2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Hpf1Q8CFE2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Hpf1Q8CFE2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Hpf1Q8CFE2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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