Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Samd4aQ8CBY1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd4aQ8CBY1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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