Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A430089I19RikQ8C9W1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.71■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A430089I19RikQ8C9W1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms