Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc90bQ8C3X2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc90bQ8C3X2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms