Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdh12Q8BYK4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdh12Q8BYK4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms