Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cldn17Q8BXA6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cldn17Q8BXA6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cldn17Q8BXA6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cldn17Q8BXA6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cldn17Q8BXA6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn17Q8BXA6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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