Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbbp5Q8BX09 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms