Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Catsper4Q8BVN3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Catsper4Q8BVN3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Catsper4Q8BVN3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Catsper4Q8BVN3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Catsper4Q8BVN3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Catsper4Q8BVN3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Catsper4Q8BVN3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Catsper4Q8BVN3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Catsper4Q8BVN3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Catsper4Q8BVN3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Catsper4Q8BVN3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms