Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nup54Q8BTS4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup54Q8BTS4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms