Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pbrm1Q8BSQ9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pbrm1Q8BSQ9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms