Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ3

Bnc2, Zinc finger protein basonuclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc2Q8BMQ3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bnc2Q8BMQ3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bnc2Q8BMQ3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms