Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trmt12Q8BG71 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trmt12Q8BG71 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms