Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M10.2Q85ZW9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-M10.2Q85ZW9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms