Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cracr2bQ80ZJ8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms