Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kdm5bQ80Y84 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kdm5bQ80Y84 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms