Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Avl9Q80U56 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Avl9Q80U56 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms