Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clec18aQ7TSQ1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clec18aQ7TSQ1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms