Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrc2bQ7TPM1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrc2bQ7TPM1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prrc2bQ7TPM1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrc2bQ7TPM1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrc2bQ7TPM1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrc2bQ7TPM1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrc2bQ7TPM1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrc2bQ7TPM1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrc2bQ7TPM1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrc2bQ7TPM1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrc2bQ7TPM1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrc2bQ7TPM1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrc2bQ7TPM1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrc2bQ7TPM1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrc2bQ7TPM1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrc2bQ7TPM1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prrc2bQ7TPM1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prrc2bQ7TPM1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms