Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stk40Q7TNL3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stk40Q7TNL3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms