Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox11Q7M6Y2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms