Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ubfd1Q78JW9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ubfd1Q78JW9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ubfd1Q78JW9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ubfd1Q78JW9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ubfd1Q78JW9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ubfd1Q78JW9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ubfd1Q78JW9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ubfd1Q78JW9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubfd1Q78JW9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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