Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ncapd3Q6ZQK0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ncapd3Q6ZQK0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms