Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smpd4Q6ZPR5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smpd4Q6ZPR5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms