Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim45Q6PFY8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim45Q6PFY8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms