Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Taf1cQ6PDZ2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Taf1cQ6PDZ2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms